TransportDB: Manajemen Basis Data Relasional dari Sistem Transportasi Membran Sel

TransportDB merupakan sebuah database relasional (manajemen basis data relasional) yang didesain untuk menggambarkan proses transportasi protein dalam membrane sel organisme. Sistem transportasi membrane dari setiap organisme yang ada diidentifikasi dan di klasifikasikan kedalam beberapa tipe berbedaberdasarkan topologi dari membrane itu sendiri, jenis protein yang terkandung, bioenergetics, dan spesifikasi subtract membrane tersebut. Sebuah webpages dibangun untuk menyediakan sebuah interface yang nyaman bagi pengguna (user friendly) agar mudah dalam hal akses dan download. Fitur-fitur tambahan seperti alat pencarian BLAST untuk mengetahui system transportasi protein dan perbandingannya dengan system transportasi sejenis milik organisme lain serta terdapat pula fitur tambaha yaitu phylogenetic trees. Transport DB ini bisa di perbaharui apabila terdapat genom-genom baru yang diinput.

source : 

TransportDB: a relational database of cellular membrane transport systems 

oleh 

Qinghu Ren, Katherine H. Kang and Ian T. Paulsen*

The Institute for Genomic Research, 9712 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850, USA

pada D284±D288 Nucleic Acids Research, 2011, Vol. 32, Database issue

DOI: 10.1093/nar/gkh016